Pour prévoir une pollution éventuelle et faire face aux problèmes environnementaux, des normes ont été instaurés pour contrôler la qualité et la salubrité des milieux naturels, en se basant sur des critères caractérisant chaque milieu.
Afin d'évaluer les taux de quelques polluants, certains paramètres physicochimiques sont mesurés dans l'eau.
Les mesures effectuées sur place (in-situ) portent sur l'évaluation de plusieurs critères : Couleur, odeur, $\mathrm{pH}$, température, $\mathrm{O}_2$ dissous,..
D'autres critères sont évalués en laboratoire: Nitrates, phosphate, chlorure, sulfates, $\mathrm{DBO}_5, \mathrm{DCO}, \ldots$
Ces mesures sont faites sur des échantillons pris dans différents point de la zone étudiée, amont et aval d'un fleuve par exemple et sur des profondeurs différentes.
Plus la $\mathrm{DBO}_5$ et la $\mathrm{DCO}$ sont élevées plus la charge polluante des eaux usées est grande.
La détermination de la qualité des eaux courantes, en termes de pollution, se fait généralement à l'aide d'indices biotiques, en utilisant des organismes aquatiques invertébrés de la macrofaune. On distingue :
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